Калоши занимали все многочисленные острова архипелага Александра, на пятьсот верст к северу и к югу от Новоархангельска, и прилегающее побережье Аляски. Калоши были диким и воинственным народом, они неоднократно нападали на русские торговые фактории, а в 1805 году даже захватили две русские крепости. Поэтому, бревенчатый частокол служил как для обороны, так для предотвращения воровства аборигенов. Большую часть населения городка составляли креолы — дети от смешанных браков русских с женщинами калошей. Много детей рождалось, также, от браков русских с женщинами союзных русским племен алеутов.

Основным делом мужчин алеутов и калошей был промысел морского зверя: выдр, котиков, сивучей и тюленей, шкуры которых обменивались в русских торговых факториях на нужные туземцам предметы обихода. Поскольку морской промысел — дело весьма опасное, множество мужчин — туземцев не доживало до преклонного возраста. К тому же, и в стычках с русскими и американскими промысловиками за пастбища морского зверя мужчины калошей часто гибли.Поэтому, вдов в племенах алеутов и калошей было много. И племена охотно отдавали этих вдов русским купцам в обмен на железные орудия труда. Огнестрельное оружие русские калошам не продавали. Однако, это делали конкурирующие с русскими за лежбища морского зверя американские промысловики.

Расположение Новоархангельска на юге русских владений на Аляске делало его климат относительно благоприятным для земледелия, и планом освоения Аляски предусматривалось сделать острова Александра сельскохозяйственной базой русской Аляски. Прохладное, умеренно-дождливое лето, мягкая зима с большим количеством осадков позволяли выращивать большинство влаголюбивых овощных культур, лен, рожь, просо и ячмень. Для скотоводства климат был вполне благоприятен, поскольку луговые выпасы для скота в окрестностях города были превосходными.

Линкор Гангут подлежал разборке на строительные материалы. Руководство строительством крепости и города Новоархангнельск поручалось местному управляющему Русско-Американской торговой компании Воеводскому.

План предусматривал строительство в Новоархангельске сильной крепости с двумя десятками мощных морских орудий. Еще два десятка орудий предполагалось установить в крепостях Павловск, Якутат и Нучек на других островах архипелага Александра. Эти крепости обеспечат контроль русских над всеми островами архипелага и прилегающим побережьем материка.

Линкор Цесаревич с адмиралом Невельским на борту после разгрузки в Новоархангельске отправился в порт Шелихов.

Основная же часть эскадры под командованием контр-адмирала Казакевича вошла в верховье залива Кука — бухту Никарм и встала там на якорь. Казакевич сам выбрал удобное место для строительства города Шелихов — будущей столицы русской Америки, названного так в честь первооткрывателя этих мест. Это место было явлено Михаилу в видениях.

Корабли высадили пассажиров и приступили к разгрузке. Старые корабли — линкор Ретвизан, фрегаты Аскольд и Севастополь, большой транспорт Амур и корвет Витязьподлежали разборке. В мощной крепости, которую предстояло построить на мысу, контролирующем вход в бухту, предстояло установить 40 морских пушек. Население города должны будут составить2300 отставных солдат и моряков. Контр-адмирал Казакевич назначался комендантом крепости.

Зима на берегахзалива Кука была холоднее, чем в Новоархангельске, зато лето — теплее. Так что выращивание овощей и разведение скота в окрестностях города было вполне возможно.

Еще 20 пушек и 700 колонистов предстояло переправить на остров Кадьяк в одноименныйгородок промысловиков, где также предстояло построить сильную крепость. Транспорт Енисей, загрузив на борт дополнительные пушки, направился туда. Там он и должен был быть разобран. Комендантом Кадьяка был назначен командир отряда фрегатов каперанг Попов.

Паровой корвет Калевала и корвет Витязь, взяв на борт половину участников научной экспедиции во главе с ее начальником Радде, отправились вдоль берегов Аляски на север к устью большой реки Юкон. Им предстояло подняться по Юкону на 2500 верст до устья реки Клондай, где основать небольшую крепость и поселок Клондай, который станет базой экспедиции. Витязь в поселке предстояло разобрать. В крепости гарнизоном встанут 350 солдат и матросов при 8 пушках. Выгрузив гарнизон и экспедицию, Калевала должен сразу спуститься вниз по реке, чтобы вернуться в Шелихов до ледостава. Экспедиции предстояло разведать золотоносные месторождения на реке Клондай.

Второй части экспедиции под руководством географа Румянцева и под охраной трех сотен солдат предстоял трудный путь от Шелихова к Клондаю по горным ущельям через неизведанные земли диких туземных племен. Отряд имел полсотни вьючных лошадей и две полевых пушки. Этой части экспедиции поручалось составить проект шоссе до Клондайка.

Император считал, что новые крепости с мощными морскими пушками и большими гарнизонами надежно закрепят за Россией владение Аляской.

Паровой корвет Калевала, вернувшийся с Юкона, самый мощный русский корабль в здешних водах, стал флагманом Дальневосточной флотилии, а командир отряда легких сил первой эскадры каперанг Лисянский — ее командором. Количество пушек на Калевале увеличили до штатных 22 штук. Флотилия, вместе с судами Русско-Американской торговой компании должна была обеспечить защиту новых городов с моря и снабжение их продовольствием из Китая и Северо-Американских штатов.